O Colégio Pedro II esteve presente ao Seminário Nacional do Ensino Médio: Construindo a Política de Ensino Médio para Todos no Brasil, realizado pelo Ministério da Educação em Brasília, de 26 a 28 de junho de 2012. Além de estudantes, o encontro reuniu técnicos do Ministério da Educação, professores, alunos, gestores e representantes das universidades para apresentações e debates sobre experiências bem-sucedidas. Estiveram presentes a Diretora-Adjunta de Ensino Médio, Profa Eliana Myra de Moraes Soares, e a Chefe do Departamento de Biologia e Ciências, Profa Lygia Vuyk de Aquino, que apresentou o trabalho intitulado “Jornadas de Meio Ambiente no Colégio Pedro I: transversalidade para a Educação Ambiental”, baseado nas experiências desenvolvidas junto ao Ensino Médio Integrado/ Técnico em Meio Ambiente da Instituição.